Papers in International Journals

• Carrasquinha, E; Amado, Conceição; Pires, Ana M. (2018)  Image reconstruction based on circulant matrices . Signal Processing: Image Communication: 63, 72-80.

• Sousa, R. G.; Nunes, A.; Meira, T.; Carreira, O.; Pires, Ana M.; Freitas, J.  (2014)  Colonoscopy and carcinoembryonic antigen variations . Arquivos de Gastroenterologia: 51(1), 69-72.

• Amado, Conceição; Bianco, Ana M.; Boente, Graciela; Pires, Ana M. (2014)  Robust Bootstrap: An Alternative to Bootstrapping Robust Estimators . REVSTAT – Statistical Journal: 12(2), 169-197.

• Lourenço, Vanda; Pires, Ana M. (2014)  M-regression, false discovery rates and outlier detection with application to genetic association studies . Computational Statistics and Data Analysis: 78, 33-42.

• Harvey, D. ; Kitching, T. D.; Noah-Vanhoucke, J.; Hamner, B.; Salimans, T.; Pires, Ana M. (2014)  Observing Dark Worlds: A crowdsourcing experiment for dark matter mapping . Astronomy and Computing: 5, 35–44.

• Goncalves, Luzia; Oliveira, M. Rosário; Pascoal, C.; Pires, Ana M. (2012)  Sample Size for Estimating a Binomial Proportion: Comparison of Different Methods . Journal of Applied Statistics: 39(11), 2453-2473.

• Lourenço, Vanda; Pires, Ana M.; Kirst, M. (2011)  Robust Linear Regression Methods in Association Studies . Bioinformatics: 27(6), 815-821.

• Boente, Graciela; Pires, Ana M.; Rodrigues, Isabel M. (2010)  Detecting Influential Observations in Principal Components and Common Principal Components . Computational Statistics & Data Analysis: 54(12), 2967-2975.

• Costa e Silva, J.; Hardner, C.; Tilyard, P.; Pires, Ana M.; Potts, B.M. (2010)  Effects of inbreeding on population mean performance and observational variances in Eucalyptus globulus . Annals of Forest Science: 67(6), 605.1-605.9.

• Pires, Ana M.; Branco, João A. (2010)  A Statistical Model to Explain the Mendel-Fisher Controversy . Statistical Science: 25(4), 545-565.

• Pires, Ana M.; Branco, João A. (2010)  Projection-pursuit approach to robust linear discriminant analysis . Journal of Multivariate Analysis: 101(10), 2464-2485.

• Boente, Graciela; Pires, Ana M.; Rodrigues, Isabel M. (2009)  Robust Tests for the Common Principal Components Model . Journal of Statistical Planning and Inference: 139(4), 1332-1347.

• Pires, Ana M.; Amado, Conceição (2008)  Interval Estimators for a Binomial Proportion: Comparison of Twenty Methods . Revstat-Statistical Journal: 6(2), 165-197.

• Boente, Graciela; Pires, Ana M.; Rodrigues, Isabel M. (2008)  Estimators for the Common Principal Components Model Based on Reweighting: Influence Functions and Monte Carlo Study . Metrika: 67(2), 189-218.

• Bianco, Ana M.; Boente, Graciela; Pires, Ana M.; Rodrigues, Isabel M. (2008)  Robust Discrimination Under a Hierarchy on the Scatter Matrices . Journal of Multivariate Analysis: 99(6), 1332-1357.

• Pires, Ana M.; Rodrigues, Isabel M. (2007)  Multiple Linear Regression with Some Correlated Errors: Classical and Robust Methods . Statistics in Medicine: 26(15), 2901-2918.

• Picado, Ana; Chankova, Stephka; Fernandes, Andrela; Simoes, Fernanda; Leverett, Dean; Johnson, Ian; Hernan, Robert; Pires, Ana M.; Matos, Jose (2007)  Genetic Variability in Daphnia Magna and Ecotoxicological Evaluation . Ecotoxicology and Environmental Safety: 67(3), 406-410.

• Todorov, Valentin; Pires, Ana M. (2007)  Comparative Performance of Several Robust Linear Discriminant Analysis Methods . Revstat-Statistical Journal: 5(1), 63-83.

• Marques, C. M.; Carocha, V. J.; De Sa, A. R. Pereira; Oliveira, M. Rosário; Pires, Ana M.; Sederoff, R.; Borralho, N. M. G. (2005)  Verification of Qtl Linked Markers for Propagation Traits in Eucalyptus . Tree Genetics & Genomes: 1(3), 103-108.

• Santos-Pereira, Carla ; Pires, Ana M. (2005)  On optimal reject rules and ROC curves . Pattern Recognition Letters: 26(7), 943-952.

• Amado, Conceição; Pires, Ana M. (2004)  Robust bootstrap with non-random weights based on the influence function . Communications in Statistics, Simulation and Computation: 33, 2, 377-396.

Papers or Chapters in Edited Books

• Santos-Pereira, Carla ; Pires, Ana M. (2013)  Robust clustering method for the detection of outliers: using AIC to select the number of clusters . Advances in Regression, Survival Analysis, Extreme Values, Markov Processes and Other Statistical Applications, Studies in Theoretical and Applied Statistics, Springer, Berlin Heidelberg, 409-415.

• Pires, Ana M.; Branco, João A. (2009)  Componentes principais: uma apreciação crítica . Estatística. Arte de Explicar o Acaso, Edições SPE, Lisboa, 537-.

• Santos-Pereira, Carla ; Pires, Ana M. (2002)  Detection of outliers in multivariate data: a method based on clustering and robust estimators. . Proceedings in Computacional Statistics, 291-296.

• Amado, Conceição; Pires, Ana M. (1999)  A utilização da função de influência para melhorar o desempenho do método de reamostragem bootstrap . Afirmar a Estatística, um desafio para o século XXI. Carlos Daniel Paulino, António Pacheco, Ana Pires e Ferreira da Cunha(eds.). Edições SPE, Lisboa., 91-99.

• Amado, Conceição; Pires, Ana M. (1998)  Uso de técnicas de reamostragem para selecção de variáveis em análise discriminante. . Estatística: a diversidade na unidade. M. Souto de Miranda e I. Pereira (eds.). Novas Tecnologias/Estatística, Edições Salamandra, Lisboa., 247-253.

Communications in Conference Proceedings

• Lourenço, Vanda; Fonseca, M.; Pires, Ana M.; Rodrigues, P.C. (2015)  Robust heritability estimation in plant studies . Proceedings of ISI 2015, 60th World Statistics Congress of the International Statistical Institute, 2640.

• Carrasquinha, E.; Amado, Conceição; Pires, Ana M. (2014)  Robust bootstrap confidence intervals: an application study for denoising images . Proceedings of the 14-th International Conference of Computational Science and its Applications (ICCSA 2014), June 30 - July 3, Guimarães, 181-185.

• Amado, Conceição; Pires, Ana M. (2000)  Robust bootstrapping using influence functions . In Jansen, W. e Bethlehem, J. G. (editores) Proceedings in Computational Statistics 2000: Short Communications and Posters, Statistics Netherlands, Voorburg,, 83-84.

Edition of Books

• Paulino, C.D. ; Pacheco, António; Pires, Ana M.; Cunha, Ferreira (1999)  Afirmar a Estatística: Um desafio para o século XXI . Edições SPE, Lisboa.

Papers in National Scientific Journals

• Amado, Conceição; Pires, Ana M. (2010)  Gráficos em R - uma breve introdução . Bulletin of the Portuguese Statistical Society: Spring issue: 1, 52-62.

• Pires, Ana M.; Amado, Conceição (2010)  Analistas de dados seduzidos pelas potencialidades do R . Bulletin of the Portuguese Statistical Society: Autumn issue: 2, 56-58.